長(zhǎng)非編碼RNA（lncRNA）在許多重要的生物過(guò)程中起著關(guān)鍵作用，包括發(fā)育、疾病和癌癥。但是，這些lncRNAs在單細(xì)胞水平上的表達(dá)和功能尚不清楚。為了更好地理解這些lncRNAs在單細(xì)胞水平上的表達(dá)和功能，可以采用靶向lncRNA的單細(xì)胞全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)。

這種技術(shù)的步驟可能包括：

1. 單細(xì)胞分離：使用流式細(xì)胞儀或微流控技術(shù)將單個(gè)細(xì)胞分離出來(lái)。
2. RNA提?。菏褂酶咝У腞NA提取方法，從單個(gè)細(xì)胞中提取RNA。
3. 靶向擴(kuò)增：設(shè)計(jì)特定的引物，只擴(kuò)增感興趣的lncRNA，或者使用特定的RNA探針靶向捕獲這些lncRNA。
4. cDNA合成：使用逆轉(zhuǎn)錄酶將RNA轉(zhuǎn)化為cDNA。
5. 庫(kù)構(gòu)建和測(cè)序：使用特定的測(cè)序庫(kù)構(gòu)建方案，如Illumina或者10x Genomics，構(gòu)建測(cè)序庫(kù)，并進(jìn)行測(cè)序。
6. 數(shù)據(jù)分析：使用專門的生物信息學(xué)工具，如STAR，HISAT2等進(jìn)行比對(duì)，然后使用cufflinks，StringTie等進(jìn)行轉(zhuǎn)錄本的重建和定量。最后，可以使用PCA，t-SNE，UMAP等工具進(jìn)行數(shù)據(jù)的可視化分析。

這種方法可以幫助研究者理解在某些特定細(xì)胞中，特定的lncRNA是如何表達(dá)的，以及這些lncRNA可能如何影響細(xì)胞的功能。

長(zhǎng)鏈非編碼RNA（long non-coding RNA，lncRNA）是一類長(zhǎng)度大于200nt，沒(méi)有蛋白質(zhì)編碼能力，或只能編碼短肽的RNA分子。在過(guò)去的幾十年中，研究者們逐漸認(rèn)識(shí)到lncRNA的重要性，發(fā)現(xiàn)lncRNA在細(xì)胞分化、生長(zhǎng)發(fā)育、免疫應(yīng)答、基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控、RNA加工修飾等方面具有重要的調(diào)節(jié)作用^[1-4]。然而，由于lncRNA的豐度普遍較低，一般只有mRNA的十分之一左右^[5]。傳統(tǒng)的測(cè)序技術(shù)包括單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)在低豐度轉(zhuǎn)錄本（比如lncRNA）的檢測(cè)上存在靈敏度不高和檢測(cè)不準(zhǔn)確等問(wèn)題，在測(cè)序建庫(kù)過(guò)程中，對(duì)低豐度的轉(zhuǎn)錄本進(jìn)行特異性的靶向擴(kuò)增，則可以實(shí)現(xiàn)對(duì)這些轉(zhuǎn)錄本更靈敏、更準(zhǔn)確的檢測(cè)。為此，我們?cè)O(shè)計(jì)了針對(duì)lncRNA的靶向panel，包含315個(gè)和148個(gè)已報(bào)道的，與人或小鼠生物學(xué)功能或疾病相關(guān)的功能性lncRNA。在單細(xì)胞測(cè)序建庫(kù)過(guò)程中，使用lncRNA靶向panel對(duì)功能性lncRNA分子進(jìn)行多重PCR擴(kuò)增，極大的提高了lncRNA的檢測(cè)靈敏度和準(zhǔn)確性，使得在單細(xì)胞水平分析低豐度、功能性lncRNA表達(dá)情況成為可能。

檢測(cè)機(jī)構(gòu)資質(zhì)證書

CMA認(rèn)證

檢驗(yàn)檢測(cè)機(jī)構(gòu)資質(zhì)認(rèn)定證書

證書編號(hào)：241520345370

有效期至：2030年4月15日

CNAS認(rèn)可

實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可證書

證書編號(hào)：CNAS L22006

有效期至：2030年12月1日

ISO認(rèn)證

質(zhì)量管理體系認(rèn)證證書

證書編號(hào)：ISO9001-2024001

有效期至：2027年12月31日

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