TMT 標(biāo)記蛋白質(zhì)組
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發(fā)布時(shí)間:2024-05-21 08:15:32 更新時(shí)間:2025-02-18 14:35:05
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TMT(Tandem Mass Tags)是由美國(guó)Thermo公司研發(fā)的體外同重同位素標(biāo)記的定量技術(shù)。該技術(shù)采用10-plex或16-plex標(biāo)記試劑,可以同時(shí)比較10組或16組樣本之間的蛋白表達(dá)差異。TMT同位素試劑標(biāo)記多肽氨基基團(tuán)后,等量混勻多肽并進(jìn)行LC-MS/MS分析。一級(jí)質(zhì)譜中,不同樣品來源的同一肽段表現(xiàn)出相同的m/Z;二級(jí)質(zhì)譜中,化學(xué)鍵斷裂釋放出報(bào)告離子,低質(zhì)量區(qū)的報(bào)告離子強(qiáng)度反映了該肽段在不同樣品中的相對(duì)表達(dá)量,高質(zhì)量區(qū)的肽段碎片離子m/Z反映了該肽段的序列信息。質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)經(jīng)過數(shù)據(jù)庫檢索,即可得到樣本中所含蛋白及其表達(dá)差異。
數(shù)據(jù)分析
標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)分析內(nèi)容 |
|
鑒定分析 |
鑒定與定量結(jié)果統(tǒng)計(jì);單個(gè)樣本蛋白質(zhì)鑒定結(jié)果統(tǒng)計(jì);韋恩圖 |
表達(dá)差異分析 |
差異結(jié)果統(tǒng)計(jì);差異結(jié)果柱狀圖;火山圖;聚類分析圖; |
多組的比較分析(組別>=3) |
mufzz聚類;雷達(dá)圖;箱線圖 |
功能分析 |
亞細(xì)胞定位;結(jié)構(gòu)域分析;GO功能分析;KEGG通路分析;互作網(wǎng)絡(luò)分析 |
質(zhì)量控制分析 |
肽段離子質(zhì)量偏差分布、肽段例子得分分布、蛋白質(zhì)豐度比分布 |
高級(jí)數(shù)據(jù)分析 |
|
功能分析 |
GSEA富集分析 |
臨床藥物研究 |
藥物靶點(diǎn)注釋 |
標(biāo)志物篩選 |
集成機(jī)器學(xué)習(xí) |
與臨床表征的聯(lián)合分析 |
熱圖;弦圖;ROC分析;WGCNA分析 |
· 推薦應(yīng)用領(lǐng)域
1. 農(nóng)林領(lǐng)域:抗逆脅迫機(jī)制,生長(zhǎng)發(fā)育機(jī)制,育種保護(hù)研究等
2. 畜牧業(yè):肉類及乳品質(zhì)研究,致病機(jī)理研究等
3. 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床診斷:生物標(biāo)志物,疾病機(jī)理機(jī)制,疾病分型,個(gè)性化治療等
4. 生物醫(yī)藥:藥物作用機(jī)理,藥效評(píng)價(jià),藥物開發(fā)等
5. 微生物領(lǐng)域:致病機(jī)理,耐藥機(jī)制,病原體-宿主相互作用研究等
6. 海洋水產(chǎn):漁業(yè)資源,海水養(yǎng)殖,漁業(yè)環(huán)境與水產(chǎn)品安全等
7. 生物能源、環(huán)境科學(xué)領(lǐng)域:發(fā)酵過程優(yōu)化,生物燃料生產(chǎn),環(huán)境危定風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估研究等
8. 食品營(yíng)養(yǎng):食品儲(chǔ)藏及加工條件優(yōu)化,食品組分及品質(zhì)鑒定,功能性食品開發(fā),食品安全監(jiān)檢測(cè)等
· 送樣建議
樣品類型 |
推薦樣本量 |
|
動(dòng)物組織類 |
常規(guī)動(dòng)物組織(腦、心、肝、脾、肺、腎、肌肉、皮膚等) |
≥30mg |
植物組織類 |
柔軟組織(木本植物的葉、花等,草本科植物,藻類,蕨類植物,大型真菌等) |
≥100mg |
微生物類 |
菌類 |
≥50mg |
細(xì)胞樣品 |
懸浮/貼壁培養(yǎng)細(xì)胞 |
≥1 × 10^7 |
體液樣本 |
血清/血漿 |
≥100μL |
外泌體 |
提取完成的外泌體 |
≥100μg |
其他類 |
細(xì)胞上清 |
≥5mL |
證書編號(hào):241520345370
證書編號(hào):CNAS L22006
證書編號(hào):ISO9001-2024001
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